2004年5月10日至14日，以西牧隆壮为团长的日本国际协力机构运营指导调查团（以下称“调查团”）对我院中日农业技术研究发展中心进行了调查访问。访问期间，调查团对中国农业可持续发展技术合作项目的运营体制、研究体制、项目实施现状及有待改善之处进行了调查。
通过与中国农科院有关领导、中日中心各部门负责人及日本专家组进行会谈，调查团对项目的总体进展及每个阶段的研究结果给予充分肯定，同时双方对中心管理职能中存在的问题、研究经费预算及综合研究等事项进行了讨论。最后，双方在项目的运营体制及研究体制方面达成共识，于13日下午就完善项目所涉及的五个研究所的指令系统、研究室、实验室、对口专家的一体化管理、仪器设备的开放与共享、运营经费预算、可持续农业技术综合研究等内容签署了备忘录。西牧团长、章力建副院长分别代表日本国际协力机构及中国农业科学院在备忘录上签字。
在这期间，还召开了“中日‘可持续农业技术研究发展计划’第二次联合协调委员会会议。
出席签字仪式和参加会议的有科技部JICA办公室阮湘平主任、中国农业科学院章力建副院长、国际合作局梁劬局长、中日农业技术研究发展中心梅旭荣副主任、承担中日合作项目的院作物科学研究、农业资源与区划研究所、饲料研究所、文献信息中心、农业环境与可持续发展研究所的有关领导等，以及日本项目运营调查团西牧隆壮团长、野口明德、惣庆嘉调查团成员、日本驻中国大使馆枝元真徹参赞、JICA中国事务所代表佐藤睦先生及日本专家组成员。